-
經(jīng)濟(jì)快捷的SNP位點(diǎn)研究方法-SNP基因分型
發(fā)布時(shí)間: 2021-10-11 點(diǎn)擊次數(shù): 1287次SNP,全稱 Single Nucleotide Polymorphisms,是指在基因組上單個(gè)核苷酸的變異。目前很多人仍然使用測(cè)序法來進(jìn)行研究,具有準(zhǔn)確、直觀的優(yōu)點(diǎn)。但有一種方法,能間接的研究SNP,且經(jīng)濟(jì)快捷,那就是——SNP基因分型。
其實(shí)現(xiàn)原理:熔解溫度(melting temperature,Tm)是指吸光值增加到最大值的一半時(shí)的溫度稱為DNA的解鏈溫度或熔點(diǎn)。當(dāng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR中的熒光探針與靶基因錯(cuò)配,即靶基因序列上產(chǎn)生了核苷酸變異,他們的熔解溫度比較低。相對(duì)而言,沒有突變的靶基因與探針雜交的熔解溫度較高。通過區(qū)分熔解溫度的差異,來區(qū)分突變型和未突變型(野生型)。
進(jìn)行SNP基因分型需要注意:
1、將突變的位點(diǎn)放在探針中間。
2、保證兩條探針的熔解溫度相同。
熒光探針中,Taqman探針可進(jìn)行SNP基因分型。推薦Applied Biosystems公司的Taqman MGB探針,相對(duì)普通Taqman探針,與錯(cuò)配序列的熔解溫度相差更大。
分子信標(biāo)也可用于SNP基因分型。他的莖環(huán)結(jié)構(gòu)比一般線性的分子探針更適合SNP分型,莖環(huán)結(jié)構(gòu)與錯(cuò)配序列雜交的熱穩(wěn)定性更低,熔解溫度相差也更大。
讀者們可根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)需求,選擇合適的方法進(jìn)行分析。
-
血清系列
-
細(xì)胞轉(zhuǎn)染
-
支原體清除
-
細(xì)胞凍存
-
實(shí)驗(yàn)耗材
-
分子試劑
-
細(xì)胞增殖與凋亡
-
Biozellen系列
-
培養(yǎng)基
-
ELISA試劑盒
-
TOYOBO(東洋紡)
-
ZYMO RESEARCH
-
Greiner(格瑞納)
-
IKA(艾卡)
-
化學(xué)發(fā)光底物(ECL)
-
PROSPEC系列
-
Epigentek系列
-
微生物檢測(cè)
-
細(xì)胞生物學(xué)
-
Corning康寧
-
解離試劑
-
細(xì)胞類-實(shí)驗(yàn)耗材
-
原代細(xì)胞
-
植物檢測(cè)系列試劑盒
-
SERANA
-
細(xì)胞系
-
生化試劑盒
-
環(huán)境檢測(cè)系列試劑盒(AKEN)
-
類器官培養(yǎng)
-
緩沖器和解決方案
-
生物三凝膠基質(zhì)
-
細(xì)胞因子分子
-
生物樣本庫